Üsküdar'da genellikle kısa boyu ve periyodik akış gösteren akarsular gelişmiştir. Bunlar ilk tabilerini genellikle Çamlıca tepeleri çevresinden alır, batıda İstanbul Boğazı'na ve güneyde Marmara Denizi'ne boşalır. Akarsu vadileri, aşağı kesimlerde genişler, özellikle deniz kıyısında küçük düzlük alanları teşkil eder. İskelelerin dağılışı, cadde ve sokakların gelişimi gibi birçok konuda akarsu şebekesinin önemli bir rolü olmuştur.
Üsküdar'da bulunan akarsuları şöyle sıralayabiliriz: Bülbül Deresi, Bekâr Deresi, Çağlayan Deresi, Çakaldağı Deresi, Çavuş Deresi, Çengelköy Deresi, Haydarpaşa Deresi, İbrahim Ağa Deresi, Karaağaç Deresi, Kara Dere, Harem Deresi, Kavak Deresi, Kaz Deresi, Kireçocağı Deresi, Köçeoğlu Deresi, Kurbağalı Dere, Seyit Ahmet Deresi, Söğütlü Çayır Deresi, Tabaklar (Debbağlar) Deresi.