Bu camii Üsküdar İskele Meydanı'ndan Kuzguncuk'a giden asfaltın sağındaki ambarlardan ve eski karakol binasından sonra gelir. Üstü ahşaptır. Caminin sağına ve soluna altından ve üstünden iki sıra halinde onar ve kıble tarafına dört pencere açılır. Cami haraptı. Mabedin ön kısmı ve minberi ahşaptır. Solunda hünkâr (padişah) mahfeli vardır. Altı kısmı taştan, üstü tuğladan yapılan minaresi mabedin sağındadır. Minarenin sağına bir basita (güneş saati) konmuştur. Altında şu kitâbe okunur:
"Resemehû Ali müezzini camii cedid der Üsküdar"
Kitabeye göre bu güneş saatini Üsküdar Yeni Camii müezzini Ali yapmıştır.
Camide kırmızı zemine siyahla yazılmış bir levhada "Bu cami Allah'ın evidir. Burada Allah'ın ismini zikr ediniz!..Sene 1180 yazıyordu. Bu levha bize caminin 1180 H. 1766 M. yapıldığını gösteriyor. Bir başka tezhipli levhada da Yazıcı Tabib diye meşhur olan Hacı Ahmed Sırrı'nın 1178 yılında Recep başlarında yazmış olduğu bu levhanın manası şudur: "Ömrün bereketi yani uzun ömürlü olmak, iyi işli olmaktır"
Bu levha caminin tamamlanmasından iki yıl evvel 1764 yılında yazılmıştır.
Camii yaptıran Mustafa Ağa 1184 H. 1770 M. yılında ölmüş ve Üsküdar'da Dedeler yakınında Yanık Ömer kapısı civarındaki hazireye gömülmüştür.
